学术报告Ⅰ：Packaging Nucleic Acids with ions, force, and nanotubes
主讲人：邱祥云
时间： 2017年6月28日下午14:00-15:30
地点： 南湖校区东配楼5楼，数学与计算机学院教工之家
摘要: Biological functions of biomolecules are closely connected with their structures and the forces animating such structures. Physical understanding of biomolecular force and structure is thus critical to unraveling their biological roles. We have a long-standing interest in how the force/structure-function relationships are manifested in the increasingly diverse lands of nucleic acids, whose biological roles are well beyond being the carrier of genetic information. In this talk, I will introduce our primary experimental technique of x-ray scattering and how it is used to measure nucleic acids force and structure, specifically in systems ranging from bare DNA in a test tube to tightly packaged genome in viruses and to the artificial system of DNA and carbon nanotube hybrids.
主讲人简介：1999年本科毕业于中国科技大学，并于Michigan State University攻读博士学位。此后，分别在Cornell University和Lab of Physics & Structural Biology of NIH 从事生物物理相关研究。于2010年加入George Washington University物理系任教至今。主要研究方向：应用物理实验手段研究生物大分子的结构、功能和动力学，及超分子的组装等。
学术报告Ⅱ：RNA动力学与RNA调控
主讲人：张文炳
时间： 2017年6月28日下午15:30-16:30
地点： 南湖校区东配楼5楼，数学与计算机学院教工之家
摘要：RNA对基因的调控与RNA动力学有关。如配体与核糖开关单元结合会引起表达单元发生构象变化，从而调控基因表达或翻译过程，实验上发现一部分核糖开关依赖于转录速率和代谢物与之相结合的动力学，其对基因的调控由其转录速率、折叠速率、配体浓度及与配体结合的速率决定；RNAi分子和细胞中的蛋白组装成RISC，RISC在RNAi的引导下完成与特定靶目标RNA的识别和结合，达到抑制靶目标基因表达的效果, RNAi的有效性也与其和靶目标的结合动力学有关。我们对单个碱基对的研究表明：形成配对速率的温度依赖性弱，其势垒为熵变，打开速率则强烈依赖于温度，其势垒为焓变。扩散系数呈现出super-Arrheinus行为。据此我们发展了RNA转录过程中折叠的动力学方法来预测RNA转录过程中结构的变化，用来研究RNA结构变化对基因的调控；我们发展RNA与靶目标结合的动力学可用来预测siRNA的有效性及miRNA靶目标。
主讲人简介：张文炳，武汉大学物理科学与技术学院教授，博士生导师。1999年获得武汉大学博士学位，并留校任教，2000年晋升为副教授。1999.11至2005.12，公派前往美国密苏里-哥伦比亚大学物理系做研究工作， 2005年12月回武汉大学，晋升为正教授，并被遴选为博士生导师。2006年入选教育部新世纪人才计划，2010年获国家自然科学二等奖（第四完成人）。目前主持多项国家自然科学基金.主要研究方向为生物大分子的统计热力学、RNA折叠动力学、生物分子间的相互作用及单分子生物物理等。
学术报告Ⅲ：Modeling & simulations for RNA structure, stability, flexibility and ion electrostatics
主讲人：谭志杰
时间： 2017年6月28日下午16:30-17:30
地点： 南湖校区东配楼5楼，数学与计算机学院教工之家
摘要：RNA作为一类重要的生物大分子，其在生物体内发挥着各种重要的功能，并且其诸多功能表达的异常往往伴随着疾病的发生。RNA这些功能的表达需依赖其特定的空间结构以及结构变化。因此，了解RNA的空间结构及其稳定性不仅有助于理解RNA的各种功能，而且还可以进一步指导一些相关应用，如药物设计、RNA纳米等。本学术报告将系统地讲述如何通过物理建模并利用分子动力学模拟研究RNA分子的结构以及稳定性和柔性等结构特性，并且还将就溶液中的离子（比如Na+、Mg2+离子）对RNA结构及稳定性的影响做详尽的讨论。
主讲人简介：谭志杰，武汉大学物理科学与技术学院教授，博士生导师。1996年武汉大学理学学士；2001年获得武汉大学理学博士学位；并留武汉大学任教，于当年底破格晋升为副教授。后公派赴美国密苏里大学合作研究，并获得该校生命科学博士后专项奖学金。2008回武汉大学并晋升为教授且遴选为博士生导师。2003年获全国优秀博士论文提名，2009年入选教育部新世纪优秀人才计划，2010年获自然科学二等奖（排名三），2011年获湖北省青年科技奖。主要研究兴趣为核酸结构、热力学和静电学的理论建模和模拟。
